日本で働く外国人従業員に係る源泉徴収、確定申告の要否

外資系企業で働く外国人従業員について、居住者・非居住者の場合の源泉徴収、確定申告が必要かどうかについて解説します。具体例を交えてご説明しますのでぜひ参考にしてください。

海外の会社から外国人が日本に派遣されてきた場合の課税について

海外（A国）の会社（A社）から外国人（A氏）が日本に派遣されて来た場合、この個人の課税関係がどうなるのか、源泉徴収されるのか、確定申告は必要か等を見ていきます。今回はその第3回目です。

第1回目では「日本へ出張した外国人に係る源泉徴収、確定申告の要否」として、外国法人A社に勤務する外国人A氏が日本に短期出張で来たケース場合を解説しました。

第2回目は、外国法人A社に勤務する外国人A氏が日本にある支店に短期出張で勤務するケースでした。

第3回目である今回は、外国法人A社に勤務する外国人A氏が日本にある子会社（いわゆる外資系企業）に従業員として勤務する場合です。

本記事では、非居住者には恒久的施設がないことを前提としています。

外国人A氏の居住者性

個人の課税関係を検討するに際しては、まず最初に居住者か非居住者かを判定する必要があります。本記事では、非居住者のままの場合と居住者になる場合の2つの場合を見ていきましょう。

居住者とは、国内に住所を有し、又は現在まで引続いて1年以上居所を有する個人を言い（所得税法2条1項3号）、それ以外の個人を非居住者と言います。

居住者や非居住者については「非居住者が居住者になる時点」の記事も参考になるのでぜひご覧ください。

その上で、下記のようにケースを分けて①課税される範囲②源泉徴収の要否③確定申告の要否④租税条約の適否の４つを検討します。

1-(1) 非居住者のままであるA氏の給与を国内子会社が負担する場合。
1-(2)非居住者のままであるA氏の給与を海外の親会社が負担する場合
2-(1)居住者（非永住者）になったA氏の給与を国内子会社が負担する場合
2-(2)居住者（非永住者）になったA氏の給与を海外の親会社が負担する場合

1非居住者の場合

1-(1) 非居住者のままであるＡ氏（従業員）の給与を国内子会社が負担する場合

 

非居住者の課税の範囲

非居住者が国内源泉所得を有するときには日本で所得税が課税されます（所得税法161条）。国外源泉徴収に対しては課税はされません。

給与所得についていえば、国内にて勤務した期間に係る給与は国内源泉所得とされ日本で課税され、国外にて勤務した期間に係る部分は国外源泉所得とされ日本では課税されません。

1(1)a 非居住者＞国内子会社給与支払＞源泉徴収の要否

非居住者（A氏）に対し、国内において給与の支払いをする場合には、その支払者は源泉徴収をする必要があります（所得税法212条1項）。税率は20.42%です（所得税法213条、復興特別所得税）

1(1)b 非居住者＞国内子会社給与支払＞確定申告の要否

非居住者が源泉徴収をされた場合、確定申告の必要はありません（所得税法172条1項）。

1(1)c 非居住者＞国内子会社給与支払＞租税条約、短期滞在者免税の適用

Ａ氏が居住者となっているＡ国と日本の間に租税条約が締結されている場合には、一定の手続きのもと短期滞在者免税が適用されて、日本での課税が免除される可能性があります。

短期滞在者免税が適用されるのは、日本以外の国の企業に雇用された者が、日本で比較的短期間勤務することにより、その外国の雇用主から受け取る給与部分に限られます。

一般的に要件は次の3つ全てを満たすことです。

1.日本滞在期間が183日を超えないこと

2.その個人の給与等が日本の居住者ではない雇用者から支払われるものであること

3.その個人の給与が雇用主の日本国内の恒久的施設（例えば支店）によって負担されないこと

本件について見ると、Ａ氏の日本滞在期間は183日以内であるが、Ａ氏の給与は日本の居住者である雇用主（日本子会社）によって負担されているので②の要件を満たさず、短期滞在者免税の規定の適用はないことになります。よって、A氏は源泉徴収の方法で課税されます。

1(2)非居住者のままであるＡ氏（従業員）の給与を海外親会社が負担する場合

 

課税範囲

非居住者はその国内源泉所得に対してのみ日本で課税されます。給与については、国内勤務期間に係る給与は国内源泉所得となります。給与の支払いを海外親会社が負担したのか日本子会社が負担したのかは関係がありません。

1(2)a 非居住者＞海外親会社給与支払＞源泉徴収の要否

原則として、非居住者に対し国外において支払いをする場合、その支払者には源泉徴収義務はありません（所得税法212条1項）。（但し、その支払者が国内に支店等の事業所を有している場合には国内にて支払いがあったものとみなされて源泉徴収義務が発生します）。

1(2)b 非居住者＞海外親会社給与支払＞確定申告の要否

非居住者が源泉徴収を受けていない場合、その年の翌年3月15日までに日本で確定申告をする必要があります。3月15日前に国内に居所を有しないことになる場合にはその有しなくなることとなる日までに確定申告が必要であり、そこでの税率は20.42%です（所得税法172条1項）。

1(2)c非居住者＞海外親会社給与支払＞短期滞在者免税の適用

先ほどのように日本子会社が給与負担する場合とは異なり、日本の居住者ではない海外親会社から給与が支払われることから、②の要件を満たすことになり、短期滞在者免税の適用があるものと考えられます。その結果、A氏の確定申告義務は免除されます。

2.非居住者の場合

続いて、A氏が日本居住者となった場合の課税関係です。

2(1). 居住者となるＡ氏（従業員）の給与を日本子会社が負担する場合

当初から１年以上滞在する予定で来日した場合にはその翌日から居住者となります。

居住者（非永住者）の課税範囲

居住者は永住者と非永住者に別れます。非永住者とは居住者のうち日本国籍を有しておらず、かつ、過去10年以内において、国内に住所又は居所を有していた期間の合計が5年以下である人を言います。非永住者以外の居住者を永住者といいます。

永住者と非永住者では、課税される所得の範囲が異なります。
非永住者が課税されるのは、国外所得以外の所得（≒国内源泉所得）、国外所得のうち日本にて支払いを受けたもの、又は日本に送金されたものです。

*1 国内源泉所得（所得税法161条）と国外源泉所得（所得税法95条4項）以外の所得はイコールではありませんが、便宜上≒としています。

（非永住者の課税範囲について）

非永住者である従業員A氏についていえば、国内勤務期間に対応する部分は国内源泉所得であり日本で課税されます。また、国外勤務期間に対応する給与は、日本にて支払い又は送金を受けた場合にのみ日本で課税されます。

例えば、A氏が母国に帰国してそこで短期間だけ勤務をした場合、その国外での勤務期間に対応する給与は国外源泉所得です。日本子会社がその分の給与を国内にて支給した場合、国外源泉所得が国内にて支払われているため、日本で課税されることになります。

2(1)a  居住者（非永住者）＞日本子会社給与支払＞源泉徴収の要否

国内勤務期間に対応する給与は源泉徴収をされます。国外勤務期間に対応する給与は国外源泉所得ですが日本での支払いとなるため日本子会社はその支払い時に源泉徴収をすることになります（所得税法183条1項）。

源泉徴収をするときの金額は、非居住者の時とは異なり源泉徴収税額表に従って決定されることが特徴です。

2(1)b 居住者（非永住者）＞日本子会社給与支払＞確定申告の要否

原則として居住者は確定申告をしなくてはなりません（所得税法120条1項）。ただし、源泉徴収と年末調整を受けている場合で給与所得が2千万円以下である場合等、一定の場合には、確定申告をする必要はありません（所得税法121条1項）。

サラリーマンをしているほとんどの居住者は、会社が源泉徴収と年末調整をしてくれ、年収も2千万円以下であれば確定申告を要しないことになりますが、より詳細な要件は国税庁の「No.1900 給与所得者で確定申告が必要な人」を参照してください。

2(1)c 居住者（非永住者）＞日本子会社給与支払＞租税条約/短期滞在者免税の適用

短期滞在者免税については、日本に短期滞在している非居住者についての規定であり、本件ではＡ氏は日本の居住者になっていることから短期滞在者免税の適用はないと考えられます。

結論としては、居住者となるＡ氏（従業員）は源泉徴収をされ、（多くの場合）確定申告は必要ありません。

2(2) 居住者となるＡ氏（従業員）の給与を海外親会社が負担する場合

海外親会社が支給する給与のうち、国内勤務期間に係るものは国内源泉所得として日本にて課税されます。国外勤務期間に係るものは、海外で支払われる国外源泉所得であるため日本での課税はありません。但し、それが日本に送金された場合には課税されることになります。

2(2)a 居住者＞海外親会社の支払い＞源泉徴収の要否

居住者の給与の支払いについては、国内にて支払いが行われた場合には、その支払者は源泉徴収をしなくてはなりません（所得税法183条1項）。国外にて支払いがなされた場合には源泉徴収義務はありません。

海外親会社が国外にて行った給与の支払いのうち、国内勤務期間に対応する部分は国内源泉所得ですが、国外での支払いであるため源泉徴収義務はありません。国外勤務期間に対応する部分は国外源泉所得であるため、日本での課税の対象ではなく源泉徴収は不要です。

2(2)b 居住者＞海外親会社の支払い＞確定申告の要否

海外親会社が支給した給与のうち、A氏の国内勤務期間に対応する給与について、海外支払であるため源泉徴収がなされていません。そこで、A氏には確定申告をする必要があります（同法120条1項）。

海外親会社が支給した給与のうち、A氏の国外勤務期間に対応する給与については、日本での課税の対象ではないため確定申告は不要となります。但し、日本に送金された場合には課税の対象となるため、確定申告が必要になります。

2(2)3 居住者＞海外親会社の支払い＞年末調整

１２月に入ると、日本国内子会社は年末調整を行います。国内子会社は親会社Ａ社が支払った給与については年末調整の対象には含めません。所得税法190条の規定により行う年末調整は、扶養控除等申告書の提出を受けた給与の支払者が支払った給与について行うことを原則としているためです。年末調整がなされていない給与所得者は、自ら確定申告を行う必要があります。

2(2)4 短期滞在者免税の適用

短期滞在者免税については、日本に短期滞在している非居住者についての規定であり、本件ではＡ氏は日本の居住者になっていることから短期滞在者免税の適用はないと考えられます。

まとめ

以上、外資系企業に勤務する外国人従業員の課税関係は、居住者か非居住者かによって取扱いが異なります。

まずは非居住者か居住者（非永住者）を判定し、次に源泉徴収、年末調整、確定申告、租税条約の適否について検討をします。この時、日本子会社支払の給与と海外親会社払いの給与とでは取扱いが異なる場合がある点、留意が必要です。